破解6.2萬余個(gè)乳酸菌基因組，首創(chuàng)性地整合菌種資源、基因組信息、臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)等關(guān)鍵指標(biāo)對(duì)乳酸菌進(jìn)行高效挖掘，基于大數(shù)據(jù)和人工智能算力為乳酸菌產(chǎn)學(xué)研開發(fā)利用搭建里程碑式的“數(shù)據(jù)橋梁”，張和平團(tuán)隊(duì)做到了。

　　近日，內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)教授張和平團(tuán)隊(duì)歷時(shí)5年建設(shè)的乳酸菌基因組數(shù)據(jù)庫iLABdb正式建成上線（https://www.imhpc.com/iLABdb），成為目前全球最大的乳酸菌基因組、功能研究數(shù)據(jù)共享數(shù)據(jù)庫和平臺(tái)。利用基因組技術(shù)為乳酸菌資源注入創(chuàng)新活力，這一重大成果的發(fā)布，展現(xiàn)了我國在微生物學(xué)研究領(lǐng)域的領(lǐng)先地位和國際影響力，也將為全球乳酸菌研究與產(chǎn)業(yè)發(fā)展貢獻(xiàn)積極力量。

　　iLABdb是借助前沿的生物信息學(xué)技術(shù)和先進(jìn)的數(shù)據(jù)分析算法建立的一個(gè)基于Web的綜合乳酸菌基因組數(shù)據(jù)共享平臺(tái),數(shù)據(jù)庫涵蓋6.2萬余個(gè)乳酸菌基因組及相關(guān)元數(shù)據(jù)，包括1.1萬余個(gè)新測序的乳酸菌基因組，由“青城之光”高性能計(jì)算公共服務(wù)平臺(tái)提供算力資源支撐。

　　乳酸菌系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系復(fù)雜，菌株間功能和代謝差異極大，難以通過傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)方法系統(tǒng)性地研究和挖掘，這大大限制了乳酸菌的開發(fā)與利用效率。張和平介紹，依托平臺(tái)，用戶可根據(jù)實(shí)際需求準(zhǔn)確高效地篩選出具有不同功效的菌株，對(duì)食品加工、農(nóng)業(yè)種植、動(dòng)物養(yǎng)殖以及生物制藥等領(lǐng)域科學(xué)研究和產(chǎn)業(yè)應(yīng)用意義重大，將最大程度地釋放“數(shù)據(jù)生產(chǎn)力”。

　　據(jù)了解，乳酸菌作為微生物領(lǐng)域重要的戰(zhàn)略資源，具有廣泛的應(yīng)用價(jià)值。張和平帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)歷時(shí)34年，從全球6大洲32個(gè)國家采集自然發(fā)酵乳制品等樣品6202份，分離保藏乳酸菌47573株，建成全球最大、種類最全的乳酸菌種質(zhì)資源庫，該資源庫入選2022年首批國家農(nóng)業(yè)微生物種質(zhì)資源庫。依托乳酸菌種質(zhì)資源庫，團(tuán)隊(duì)于2018年啟動(dòng)了“乳酸菌萬株基因組計(jì)劃”，利用自建菌種資源庫中1.1萬株完成測序的乳酸菌全基因組序列，并結(jié)合現(xiàn)有公共數(shù)據(jù)庫中5.19萬個(gè)乳酸菌基因組數(shù)據(jù)，建立了iLABdb數(shù)據(jù)庫，相關(guān)科研成果發(fā)表于《Science Bulletin》（《科學(xué)通報(bào)（英文版）》）。（記者 白蓮）