人類四肢是如何長出來的
把雞胚胎里形成前肢的細(xì)胞團(tuán)切下,移植到背部,竟然能夠長出完整的翅膀;去除成年蠑螈的腿,它能夠很快再生,即使在切除8次到10次之后,依然能長出新的腿,且?guī)缀蹩床怀鰝?。然而,包括人在?nèi),大多數(shù)哺乳動物卻在進(jìn)化過程中喪失了這種成年后再生能力。
近日,中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院教授張宏波課題組在英國《自然》雜志發(fā)表論文,發(fā)布了首個人類肢體發(fā)育單細(xì)胞時空圖譜,解析了胎兒四肢的細(xì)胞演變路徑和細(xì)胞空間位置決定過程。
該成果為進(jìn)一步研究肢體發(fā)育的詳細(xì)調(diào)節(jié)機(jī)制、肢體發(fā)育異常的細(xì)胞生理機(jī)制,乃至更廣泛的發(fā)育和再生過程中細(xì)胞命運(yùn)調(diào)節(jié)機(jī)制和空間位置建成機(jī)制提供了重要參考。
在這項(xiàng)研究中,張宏波團(tuán)隊(duì)與合作者試圖回答兩個關(guān)鍵問題:肢體細(xì)胞的發(fā)展是如何決定的?例如,為何原本一樣的細(xì)胞,有的后來變成了纖維細(xì)胞,有的成為骨骼的一部分?細(xì)胞的空間位置又是如何決定的?例如,一只正常發(fā)育的手為什么是5根手指,為什么大拇指的方向跟其他4根手指不一樣?
探秘生命科學(xué)底層問題
張宏波團(tuán)隊(duì)從第五周初到第九周胚胎連續(xù)取樣,獲得超過10萬個細(xì)胞,每個細(xì)胞約2000個基因,通過計算分析,團(tuán)隊(duì)率先構(gòu)建起精細(xì)的、包含所有細(xì)胞類型的人類四肢發(fā)育單細(xì)胞圖譜。
通過團(tuán)隊(duì)自主研發(fā)的單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析工具——DEAPLOG,他們還能夠更好地找到每一個細(xì)胞的特征,尋找到關(guān)鍵基因,并在此基礎(chǔ)上將這些基因錨定到細(xì)胞演變的路徑上。
為什么人的四肢切除后就不能再生長?在張宏波看來,肢體建成的時空調(diào)節(jié)機(jī)制是一個經(jīng)典的發(fā)育生物學(xué)難題。發(fā)育與再生本質(zhì)上具有相似性,如果能夠加深對發(fā)育的理解,就可能對四肢的再生建構(gòu)起本質(zhì)上的前提和基礎(chǔ)。
“對這一過程的任何微小擾動都可能產(chǎn)生顯著的下游效應(yīng)?!闭撐墓餐谝蛔髡?、張宏波團(tuán)隊(duì)博士后王帥玉發(fā)現(xiàn),四肢發(fā)育異常是全球報告最多的出生綜合征之一,全球大約每500名新生兒即可發(fā)現(xiàn)一例。
單細(xì)胞技術(shù)為揭秘創(chuàng)造可能
長期以來,科學(xué)家在研究這個問題時,會在小鼠、雞等模式動物上進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。一系列肢體形成的基本問題,如近遠(yuǎn)軸的幾個關(guān)鍵決定基因、前后軸的基本細(xì)胞定位和信號通路等已經(jīng)得到初步闡釋。然而,囿于技術(shù)和倫理限制,人類肢體發(fā)育詳細(xì)的細(xì)胞演變路徑、決定細(xì)胞命運(yùn)的關(guān)鍵基因與疾病的聯(lián)系等尚未研究。更重要的是,模式動物中發(fā)現(xiàn)的肢體形成機(jī)制與人類有多大的相似性,以及有多大程度可以用于人類再生醫(yī)學(xué)實(shí)踐亦長期存疑。
以往,科學(xué)家只能追蹤某一種細(xì)胞的發(fā)育路徑,比如肌肉細(xì)胞、骨細(xì)胞的命運(yùn),頂多同時追蹤兩到三種細(xì)胞,無法看到所有細(xì)胞的命運(yùn)是如何演化的。而對于細(xì)胞的空間位置決定,科學(xué)家通過對胚胎做切片,然后進(jìn)行單一或少數(shù)細(xì)胞染色,了解到的基因數(shù)量十分有限。
而單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)和單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的發(fā)展,使得探秘細(xì)胞演化過程成為可能。
演化的過程如何調(diào)控?張宏波認(rèn)為,這依賴于細(xì)胞之間非常迅速而精確的協(xié)調(diào)。他說,在發(fā)育過程中,人類四肢的形成并非一蹴而就,而是經(jīng)歷過復(fù)雜的細(xì)胞演變過程。在胚胎發(fā)育第四周末,四肢僅以簡單的幾乎均一細(xì)胞團(tuán)形狀凸起出現(xiàn)在身體的兩側(cè),但到了第八周,這一細(xì)胞團(tuán)則已經(jīng)完全分化,形成具有復(fù)雜解剖結(jié)構(gòu)的四肢,并形成完整的手指和腳趾。
在此基礎(chǔ)上,團(tuán)隊(duì)利用空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)精確定位已知類型細(xì)胞在肢體中的確切位置,以及隨著發(fā)育時間變化細(xì)胞位置的變化規(guī)律。論文共同第一作者、張宏波團(tuán)隊(duì)博士后張寶介紹,利用這一圖譜,他們能夠直觀地追蹤特定時間和區(qū)域產(chǎn)生的細(xì)胞類型,鑒定到全新的細(xì)胞類型,并且可以刻畫不同種類細(xì)胞激活的關(guān)鍵基因。
“當(dāng)這些基因的表達(dá)不遵循既定模式,而又行使關(guān)鍵調(diào)控作用時,就可能導(dǎo)致特殊的發(fā)育表型,比如短指(手指或腳趾短)和多指(多余的手指或腳趾)等發(fā)育異常的現(xiàn)象。”張寶說。
再生醫(yī)學(xué)更多應(yīng)用未來可期
“我們關(guān)注的是細(xì)胞命運(yùn)的兩極,也就是發(fā)育和衰老,現(xiàn)正在慢慢打通中間的環(huán)節(jié)?!睆埡瓴ㄍ嘎叮瑘F(tuán)隊(duì)同時在開展關(guān)于人體肌肉衰老的研究,探究肌肉里面存在哪些細(xì)胞類型,又是如何相互作用造成肌肉衰老的。
目前,該研究的相關(guān)技術(shù)在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的直接應(yīng)用仍然較少,但對細(xì)胞命運(yùn)決定的深入理解,將使其未來應(yīng)用成為可能。例如,間充質(zhì)干細(xì)胞和成纖維細(xì)胞因其具有變成多種細(xì)胞的能力,在人體組織損傷后會自發(fā)用于組織修復(fù),但現(xiàn)階段廣泛的臨床醫(yī)學(xué)應(yīng)用則面臨許多風(fēng)險,這包括防止細(xì)胞的過度增生、病變等。
“要實(shí)現(xiàn)更多的應(yīng)用,就要對細(xì)胞發(fā)育、生長有更多的認(rèn)識。認(rèn)識得越多,就越可控?!睆埡瓴ㄕf。
據(jù)悉,中山大學(xué)張宏波教授、英國Sanger研究所Sarah Teichmann教授為該論文共同通訊作者。張寶、Peng He(Sarah Teichmann課題組博士后)、John Lawrence(Sarah Teichmann課題組博士生)、王帥玉為該論文共同第一作者。
中青報·中青網(wǎng)記者 林潔 通訊員 朱嘉豪 李建平 來源:中國青年報
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