我國科研人員構(gòu)建首個雙生病毒—植物—昆蟲數(shù)據(jù)庫
科技日報訊 (記者馬愛平 通訊員郭建英)3月21日,科技日報記者從中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護研究所獲悉,該所作物病原生物功能基因組研究創(chuàng)新團隊聯(lián)合國內(nèi)其他科研單位,構(gòu)建了國際首個雙生病毒—植物—昆蟲數(shù)據(jù)庫。該數(shù)據(jù)庫提供了最完整的雙生病毒、寄主植物、傳毒介體、病毒—植物—昆蟲互作信息,并提供多種在線工具,可實現(xiàn)相關(guān)文獻同步更新。相關(guān)研究成果在線發(fā)表于《分子植物》。
雙生病毒是全球范圍內(nèi)對植物危害最嚴(yán)重的病原物之一,有520余種,可通過煙粉虱、葉蟬和蚜蟲等傳播,侵染棉花、番茄及瓜果等多種重要經(jīng)濟作物,造成嚴(yán)重的經(jīng)濟損失。
該數(shù)據(jù)庫可完成病毒、寄主信息的完整搜索與下載,為雙生病毒的后續(xù)研究奠定了重要基礎(chǔ)。數(shù)據(jù)庫將病毒—植物—昆蟲的互作關(guān)系進行可視化,通過雙生病毒全基因組序列比對,構(gòu)建了目前最為全面的雙生病毒科的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系;同時該數(shù)據(jù)庫提供比對功能,可對病毒基因、蛋白進行比對與搜索,并及時更新雙生病毒相關(guān)研究進展。
(科技日報)
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