中新網(wǎng)北京1月24日電 (記者 孫自法)施普林格·自然旗下學(xué)術(shù)期刊《自然-通訊》最新發(fā)表一篇遺傳學(xué)論文稱,研究人員報(bào)告了占全球咖啡產(chǎn)量約60%的阿拉比卡咖啡的改良基因組組裝,這項(xiàng)植物基因組研究發(fā)現(xiàn)揭示了咖啡遺傳多樣性的來源,可能促成了它獨(dú)特的風(fēng)味與抗病性。
該論文介紹,商業(yè)咖啡主要由中果咖啡和小果咖啡組成,即所謂羅布斯塔咖啡和阿拉比卡咖啡。阿拉比卡咖啡是今日羅布斯塔咖啡的祖先和另一種近親咖啡物種雜交的產(chǎn)物。這一雜交帶來了阿拉比卡咖啡的風(fēng)味和它巨大、復(fù)雜的基因組,造成培育和遺傳研究上的挑戰(zhàn)。目前已經(jīng)有了一些阿拉比卡咖啡的部分基因組組裝,但產(chǎn)生其遺傳多樣性的機(jī)制尚不明確。
本項(xiàng)研究中,論文共同通訊作者、意大利烏迪內(nèi)大學(xué)Michele Morgante和意大利應(yīng)用遺傳學(xué)研究所Gabriele Di Gaspero與同事及合作者一起,通過使用最新測序技術(shù),生成了阿拉比卡咖啡更完整的基因組組裝,使得人們能對其染色體結(jié)構(gòu)進(jìn)行詳細(xì)分析。
在分析包括此前無法獲得的基因組(如著絲粒周圍)時(shí),論文作者發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)祖先物種造成的基因組結(jié)構(gòu)、功能和演化差異,特別是涉及咖啡因生物合成的基因。
他們還分析了174個(gè)樣本的基因組,收集自咖啡屬的不同物種,注意到在阿拉比卡咖啡中存在很低水平的遺傳多樣性。在一些阿拉比卡咖啡栽培品種的特定遺傳區(qū)域,多樣性有所增加,來自兩個(gè)不同變異源:染色體異常,和一種羅布斯塔-阿拉比卡雜交種(即“帝汶”混合種)來源的遺傳片段。這一雜交品種是許多現(xiàn)代栽培種的親本品系,結(jié)合了羅布斯塔咖啡的抗病性和阿拉比卡咖啡獨(dú)特的風(fēng)味。
論文作者總結(jié)認(rèn)為,阿拉比卡咖啡豆遺傳多樣性對其商業(yè)成功不可或缺,這項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)或有助于開發(fā)新的帶有人們所需特性的咖啡品種,例如抗病性或不同風(fēng)味特征。(完)
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