【曬曬咱的國之重器14】短視頻丨國家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心
【曬曬咱的國之重器14】
細(xì)菌、病毒、真菌、支原體、衣原體……
談及它們,你定會(huì)避之不及。但是,你知道嗎?在地球生物圈,它們占據(jù)著重要位置——環(huán)境、食品、醫(yī)藥、健康、工業(yè)、農(nóng)業(yè)、化學(xué)化工、材料、生物安全,與人類存續(xù)相關(guān)的所有環(huán)節(jié),幾乎都與它們有關(guān)。其家族成員還包括放線菌、立克次氏體、螺旋體……它們,都是微生物。
微生物研究,是科技界持續(xù)關(guān)注的熱點(diǎn),也正因此,微生物科學(xué)數(shù)據(jù)成為一種重要戰(zhàn)略資源。
2019年6月,作為我國首批啟動(dòng)的20個(gè)國家科學(xué)數(shù)據(jù)中心之一,依托中科院微生物研究所,與中國疾控中心傳染病所、中科院海洋所、中科院上海植物生理生態(tài)研究所、中科院計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)信息中心等單位共建的國家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心,開始承擔(dān)起保存、整合、挖掘、利用微生物科學(xué)數(shù)據(jù)的重大使命。
模式微生物、基因序列、標(biāo)本、菌種……從開始的自有數(shù)據(jù)共享,到如今,國家科技計(jì)劃匯交數(shù)據(jù)、期刊數(shù)據(jù)、華大基因等測序公司數(shù)據(jù)源源不斷地匯集,你能想象嗎?這里,已匯集數(shù)據(jù)條數(shù)超過40億、3PB;這里,已成為我國最重要、在世界上有極大影響力的微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心。
不僅如此,國家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心還制定了第一個(gè)微生物數(shù)據(jù)領(lǐng)域的國際ISO數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn),覆蓋資源、物種、組學(xué)、功能等方面的數(shù)據(jù)管理與發(fā)布。他們還在此基礎(chǔ)上開發(fā)了擁有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的數(shù)據(jù)管理平臺(tái),在國內(nèi)外上百家單位使用。
中心主任、中科院微生物所研究員馬俊才時(shí)常會(huì)被問到這樣一個(gè)問題:“國際上已經(jīng)有GENBANK、GISAID等比較知名的微生物數(shù)據(jù)庫,如果科學(xué)是無國界的,為什么我們還要建立自己的數(shù)據(jù)庫?”
馬俊才的回答總是耐心而堅(jiān)定——
“國家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心與這些數(shù)據(jù)庫從來不是非此即彼的關(guān)系,它的建立,既是為了保障國家微生物數(shù)據(jù)主權(quán),也是為了依法依規(guī)推動(dòng)數(shù)據(jù)共享和國際交流?!?/p>
馬俊才說,目前幾家比較大的數(shù)據(jù)庫均在國外,數(shù)據(jù)收錄和公布的流程比較復(fù)雜、時(shí)間比較長,有些數(shù)據(jù)庫的下載還要收費(fèi)。
“我們國家財(cái)政支持的科研所產(chǎn)生的數(shù)據(jù),中國科學(xué)家使用還得給別人交錢,這合理嗎?”
好消息來了!馬俊才說,作為國家科技資源共享服務(wù)平臺(tái),中心數(shù)據(jù)資源全部免費(fèi)共享,“這從某種程度上解決了我國科學(xué)家不能使用我國數(shù)據(jù)的窘境”。
有了科學(xué)數(shù)據(jù),還要讓數(shù)據(jù)“活”起來——
國家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心在數(shù)據(jù)的加工整理和分析挖掘上下了大功夫。馬俊才說,他們以國家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心為依托,與國家食品安全領(lǐng)域開展合作,建立了國家食源性致病微生物全基因組數(shù)據(jù)庫及溯源網(wǎng)絡(luò),對31個(gè)省區(qū)市的60種食品基質(zhì)、9000株細(xì)菌、500株真菌、500株病毒的菌種進(jìn)行測序,并建立了相應(yīng)的大數(shù)據(jù)平臺(tái)和應(yīng)用系統(tǒng),保障國家食品安全。
接下來的目標(biāo)是什么?馬俊才說:“我們也在不斷提升自己的能力和國際影響力,建立更多數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)、牽頭國際重大合作計(jì)劃,爭取吸引更多國內(nèi)、國際科學(xué)家把科學(xué)數(shù)據(jù)提供給我們,建立更多具有國際權(quán)威的微生物數(shù)據(jù)庫。”
?。?022年01月04日 01版)
監(jiān)制:張寧 廖慧
策劃:李方舟 李宜蒙
配音:張悅鑫
剪輯:董大正
制作:光明網(wǎng)新聞中心
采訪:光明日報(bào)全媒體記者 齊芳
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